九宮八卦風水學中的層數主要指的是「九宮飛星」的應用層次，通常分為三層：
基礎層：主要用於住宅、辦公室等小型空間的風水布局，通過九宮格劃分空間，結合八卦方位進行分析，調整氣場。
中級層：適用於較大範圍的環境，如社區、村莊等，結合地形、水流等自然環境進行綜合分析，優化整體風水格局。
高級層：應用於城市規劃、大型建築群等宏觀層面，結合天文、地理、人文等多方面因素，進行深層次的風水設計與調整。
這三層次體現了九宮八卦風水學從微觀到宏觀的應用範圍，具有較高的實用性和靈活性。