傳說中的寶可夢通常具有獨特且強大的能力，這些能力使它們在寶可夢世界中顯得格外特殊。以下是一些常見的特殊能力：
操控自然力量：許多傳說中的寶可夢能夠操控自然元素，例如天氣、海洋、大地和天空。例如，蓋歐卡（Kyogre）能夠引發降雨和擴大海洋，而固拉多（Groudon）則能引發乾旱並擴大陸地。
時間與空間的操控：某些傳說中的寶可夢擁有控制時間和空間的能力。例如，帝牙盧卡（Dialga）可以操控時間，帕路奇亞（Palkia）可以操控空間，而騎拉帝納（Giratina）則能夠穿梭於不同的維度。
生命與死亡的掌控：一些傳說中的寶可夢與生命和死亡的力量相關。例如，哲爾尼亞斯（Xerneas）能夠賦予生命，而伊裴爾塔爾（Yveltal）則能夠吸收生命。
創造與毀滅：某些傳說中的寶可夢擁有創造或毀滅世界的能力。例如，阿爾宙斯（Arceus）被認為是創造寶可夢世界的至高存在，而超夢（Mewtwo）則是通過基因改造創造出的強大寶可夢。
心靈感應與精神控制：許多傳說中的寶可夢具有強大的心靈感應能力，能夠與人類或其他寶可夢進行心靈溝通。例如，超夢（Mewtwo）和夢幻（Mew）都具有強大的心靈感應能力。
形態變化：一些傳說中的寶可夢能夠改變形態，從而獲得不同的能力或屬性。例如，烈空坐（Rayquaza）在超級進化後能夠獲得更強大的力量，而基格爾德（Zygarde）則可以根據細胞收集的數量改變形態。
守護與平衡：某些傳說中的寶可夢被視為守護者，負責維持世界的平衡。例如，雷吉奇卡斯（Regigigas）被認為是創造了其他雷吉系列寶可夢的存在，而基格爾德（Zygarde）則負責維持生態系統的平衡。
這些特殊能力不僅使傳說中的寶可夢在戰鬥中極為強大，也使它們在寶可夢的傳說和歷史中占據重要地位。