台灣的心理諮商研究所是培養專業心理諮商師的重要學術機構，這些研究所通常隸屬於大學的心理學系或教育學院。以下是台灣幾所知名大學的心理諮商研究所：
國立台灣師範大學教育心理與輔導學系
該校的心理諮商研究所以培養專業心理輔導人員為主，課程涵蓋心理諮商理論、技術與實務，並提供豐富的實習機會。
國立台北教育大學心理與諮商學系
該研究所專注於心理諮商與教育心理學的結合，培養學生在教育場域中提供心理輔導的能力。
國立彰化師範大學輔導與諮商學系
彰師大的諮商研究所是台灣最早成立的相關科系之一，課程設計完善，並與多所學校及機構合作，提供實務訓練。
國立高雄師範大學諮商心理與復健諮商研究所
該研究所結合諮商心理與復健諮商，培養學生在身心障礙者及特殊需求群體中的輔導能力。
東吳大學心理學系諮商心理學組
東吳大學的諮商心理學組強調理論與實務並重，課程設計多元，並與社區及醫療機構合作。
輔仁大學心理學系諮商心理學組
輔仁大學的諮商心理學組以全人教育為理念，培養學生在多元文化背景下的諮商能力。
這些研究所的課程通常包括心理諮商理論、心理測驗與評估、團體諮商、家庭諮商、危機處理等內容，並要求學生完成一定時數的實習。畢業生可以參加國家考試，取得心理師執照，並在學校、醫院、企業或私人機構中從事心理諮商工作。
此外，台灣的心理諮商研究所也積極參與國際交流與合作，提升學術研究與實務應用的水準。