在《寶可夢》系列遊戲中，寶可夢的性別差異主要體現在以下幾個方面：
外觀差異：部分寶可夢的雄性與雌性在外觀上會有明顯的不同。例如，皮卡丘的雌性尾巴末端呈心形，而雄性的尾巴則為直線形。又如，火爆猴的雌性頭頂的毛髮較短，而雄性則較長。
性別比例：每種寶可夢的性別比例不同。有些寶可夢的性別比例為1:1，即雌雄各佔一半；有些則偏向某一性別，例如伊布有87.5%的機率為雄性，12.5%為雌性。
繁殖與遺傳：在繁殖系統中，只有雌性寶可夢可以與其他寶可夢進行繁殖，但與百變怪繁殖時則不受性別限制。此外，某些招式或特性只能通過特定性別的寶可夢遺傳給後代。
特性與招式：某些特性或招式可能與性別相關。例如，雌性寶可夢可能更容易觸發某些特性，或是只能學會特定性別才能使用的招式。
進化條件：部分寶可夢的進化條件與性別有關。例如，只有雌性的三蜜蜂可以進化成蜂女王，而雄性則無法進化。
這些性別差異為遊戲增添了更多策略性和趣味性，玩家在捕捉、培養和對戰時需要考慮性別因素。