《寶可夢》系列有許多漫畫作品，其中最著名的是由日下秀憲編劇、山本智作畫的《寶可夢特別篇》（Pokémon Adventures）。這部漫畫自1997年開始連載，至今仍在持續更新，是《寶可夢》系列中最受歡迎的漫畫之一。
《寶可夢特別篇》的故事情節與遊戲和動畫有所不同，角色和劇情更加豐富，且更貼近遊戲的設定。漫畫中的主角包括小赤、小綠、小藍等，他們在不同的地區展開冒險，並與各種寶可夢相遇和戰鬥。
台灣和香港地區的中文版由青文出版社和香港天下出版有限公司分別出版，大陸地區則由吉林美術出版社引進發行。這些中文版漫畫深受華語地區讀者的喜愛，成為許多寶可夢迷的收藏品。
此外，還有其他以寶可夢為主題的漫畫作品，例如《寶可夢鑽石·珍珠篇》、《寶可夢XY篇》等，這些漫畫也都有中文版發行，供不同年齡層的讀者閱讀。