《寶可夢 朱／紫》中的寶主是遊戲中一種特殊的野生寶可夢，擁有強大的力量和獨特的外觀。這些寶主寶可夢通常比普通的寶可夢更難捕捉，並且在戰鬥中會展現出更強的實力。以下是《寶可夢 朱／紫》中已知的寶主寶可夢：
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岩壁寶主：毛崖蟹（Klawf）
- 屬性：岩石
- 特性：憤怒甲殼（Shell Armor）或硬爪（Tough Claws）
- 毛崖蟹是一種大型的岩石屬性寶可夢，外觀類似螃蟹，擁有堅硬的外殼和強大的鉗子。
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長空寶主：下石鳥（Bombirdier）
- 屬性：飛行／惡
- 特性：威嚇（Intimidate）或強行（Sheer Force）
- 下石鳥是一種飛行與惡屬性的寶可夢，擁有鳥類的外觀，擅長從空中投擲岩石攻擊敵人。
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潛鋼寶主：拖拖蚓（Orthworm）
- 屬性：鋼
- 特性：沙隱（Sand Veil）或金屬防護（Metalic Body）
- 拖拖蚓是一種鋼屬性的寶可夢，外形類似蚯蚓，擁有堅硬的金屬外殼，能夠在地下快速移動。
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偽龍寶主：吃吼霸（Tatsugiri）
- 屬性：龍／水
- 特性：龍之威嚴（Dragon's Majesty）或濕潤之軀（Water Absorb）
- 吃吼霸是一種龍與水屬性的寶可夢，外形類似魚類，擁有強大的水系和龍系技能。
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土震寶主：雄偉牙（Great Tusk）或鐵轍跡（Iron Treads）
- 屬性：地面／格鬥（雄偉牙）或地面／鋼（鐵轍跡）
- 特性：沙之力（Sand Force）或鋼之意志（Iron Will）
- 這兩種寶主寶可夢分別是《寶可夢 朱》和《寶可夢 紫》的專屬寶主，擁有強大的地面屬性技能。
這些寶主寶可夢在遊戲中扮演著重要的角色，擊敗它們可以獲得特殊的獎勵，並且有助於推進劇情。捕捉這些寶主寶可夢需要玩家具備足夠的實力和策略。