格鬥系寶可夢在戰鬥中主要被以下幾種屬性克制：
- 飛行系：飛行系技能對格鬥系寶可夢效果顯著，因為格鬥系寶可夢通常缺乏對空中的防禦手段。
- 超能力系：超能力系技能對格鬥系寶可夢有很好的效果，因為格鬥系寶可夢通常以物理攻擊為主，而超能力系技能多為特殊攻擊，能夠有效避開格鬥系寶可夢的防禦。
- 妖精系：妖精系技能對格鬥系寶可夢也有很好的效果，因為格鬥系技能對妖精系寶可夢效果不佳，而妖精系技能則能對格鬥系寶可夢造成較大傷害。
此外，格鬥系寶可夢通常對岩石系、鋼系和冰系寶可夢有優勢，但在面對上述克制屬性時需要特別小心。