水系寶可夢在《寶可夢》系列中一直占據著重要地位，因其多樣性和強大的戰鬥力而備受玩家喜愛。以下是基於綜合實力、對戰表現及人氣的水系寶可夢排行（排名不分先後）：
1. 蓋歐卡
作為傳說中的寶可夢，蓋歐卡擁有強大的特攻和耐久能力，其特性「降雨」能夠改變天氣，為水系隊伍提供巨大優勢。在對戰中，蓋歐卡是天氣隊中的核心成員，實力毋庸置疑。
2. 水箭龜
作為初代御三家之一，水箭龜憑藉其均衡的屬性和經典的造型深受玩家喜愛。Mega進化後，水箭龜的特攻能力大幅提升，成為水系特攻手中的佼佼者。
3. 暴鯉龍
暴鯉龍是水系與飛行系的雙屬性寶可夢，擁有極高的攻擊力。其特性「威嚇」能夠降低對手的攻擊力，在對戰中具有極強的控場能力。Mega進化後，暴鯉龍更是成為物理攻擊的頂級選手。
4. 美納斯
美納斯以其優雅的外形和強大的特防能力著稱，是水系寶可夢中的「坦克」。其特性「神奇鱗片」在異常狀態下能大幅提升防禦力，使其在對戰中極具韌性。
5. 巨沼怪
巨沼怪是水系與地面系的雙屬性寶可夢，擁有極高的耐久性和攻擊力。其Mega進化形態更是成為對戰中的強力物攻手，尤其在雨天隊中表現出色。
6. 西獅海壬
作為第七世代的御三家之一，西獅海壬憑藉其獨特的妖精屬性組合和強大的特攻能力脫穎而出。其技能池豐富，能夠應對多種對戰場景。
7. 刺龍王
刺龍王是水系與龍系的雙屬性寶可夢，擁有極高的特攻和速度。在雨天隊中，刺龍王能夠發揮出極強的爆發力，成為對戰中不可忽視的威脅。
8. 水君
作為傳說中的寶可夢，水君以其優雅的外形和強大的特防能力著稱。其特性「精神力」能夠防止對手的畏縮效果，使其在對戰中具有極高的穩定性。
9. 甲賀忍蛙
甲賀忍蛙憑藉其獨特的「變幻自如」特性（隱藏特性）和高速高攻的特點，成為對戰中極具威脅的存在。其小智版甲賀忍蛙更是因其獨特的造型和表現成為人氣極高的寶可夢。
10. 戽斗尖梭
戽斗尖梭是第八世代的寶可夢，憑藉其極高的速度和攻擊力成為對戰中極具威脅的水系寶可夢。其特性「悠遊自如」在雨天中能夠大幅提升速度，使其成為速攻手中的佼佼者。
以上排名僅供參考，實際對戰中寶可夢的表現還取決於訓練家的策略和隊伍搭配。水系寶可夢的多樣性和強大實力使其在《寶可夢》系列中始終占據重要地位。