淨化結晶寶可夢，又稱淨化結晶神奇寶貝，是寶可夢系列中的一種特殊形態。這些寶可夢通常與特定的淨化儀式或特殊道具相關，能夠通過淨化來改變其形態或屬性。淨化結晶寶可夢的概念最早出現在《寶可夢 紅寶石/藍寶石》系列中，與「淨化結晶」這一道具密切相關。
在遊戲中，淨化結晶寶可夢通常是受到黑暗能量影響的寶可夢，例如「黑暗寶可夢」（Shadow Pokémon），這些寶可夢在戰鬥中表現出異常的攻擊性和能力。玩家需要通過特定的淨化儀式，使用淨化結晶道具來恢復這些寶可夢的正常狀態，使其回歸原本的形態和能力。
淨化結晶寶可夢的設計不僅增加了遊戲的深度和挑戰性，還為玩家提供了更多的收集和培養樂趣。這一機制也體現了寶可夢系列中「友誼與信任」的核心價值觀，強調了玩家與寶可夢之間的羈絆。
此外，淨化結晶寶可夢在動畫和漫畫中也有出現，通常作為劇情中的重要元素，推動故事發展，並展現出寶可夢與訓練家之間的情感聯繫。