第四世代寶可夢圖鑑包含了《寶可夢鑽石·珍珠》和《寶可夢白金》中引入的全新寶可夢。以下是第四世代寶可夢的部分列表：
- 草苗龜（編號387）：草屬性，進化後為樹林龜和土台龜。
- 小火焰猴（編號390）：火屬性，進化後為猛火猴和烈焰猴。
- 波加曼（編號393）：水屬性，進化後為波皇子和帝王拿波。
- 姆克兒（編號396）：一般/飛行屬性，進化後為姆克鳥和姆克鷹。
- 大牙狸（編號399）：一般屬性，進化後為大尾狸。
- 小貓怪（編號403）：電屬性，進化後為勒克貓和倫琴貓。
- 含羞苞（編號406）：草/毒屬性，進化後為毒薔薇和羅絲雷朵。
- 頭蓋龍（編號408）：岩石屬性，進化後為戰槌龍。
- 盾甲龍（編號410）：岩石/鋼屬性，進化後為護城龍。
- 結草兒（編號412）：蟲屬性，進化後為結草貴婦或紳士蛾，取決於性別。
- 櫻花寶（編號420）：草屬性，進化後為櫻花兒。
- 無殼海兔（編號422）：水屬性，進化後為海兔獸。
- 小卡比獸（編號446）：一般屬性，進化後為卡比獸。
- 利歐路（編號447）：格鬥屬性，進化後為路卡利歐。
- 圓陸鯊（編號443）：龍/地面屬性，進化後為尖牙陸鯊和烈咬陸鯊。
- 由克希（編號480）：超能力屬性，傳說中的寶可夢。
- 艾姆利多（編號481）：超能力屬性，傳說中的寶可夢。
- 亞克諾姆（編號482）：超能力屬性，傳說中的寶可夢。
- 帝牙盧卡（編號483）：鋼/龍屬性，傳說中的寶可夢。
- 帕路奇亞（編號484）：水/龍屬性，傳說中的寶可夢。
- 騎拉帝納（編號487）：幽靈/龍屬性，傳說中的寶可夢。
- 克雷色利亞（編號488）：超能力屬性，傳說中的寶可夢。
- 霏歐納（編號489）：水屬性，傳說中的寶可夢。
- 瑪納霏（編號490）：水屬性，傳說中的寶可夢。
- 達克萊伊（編號491）：惡屬性，傳說中的寶可夢。
- 謝米（編號492）：草屬性，傳說中的寶可夢。
- 阿爾宙斯（編號493）：一般屬性，傳說中的寶可夢。
第四世代的寶可夢圖鑑共有107隻寶可夢，其中包括了許多新的寶可夢和傳說中的寶可夢。這些寶可夢在《寶可夢鑽石·珍珠》和《寶可夢白金》中首次亮相，為玩家帶來了全新的冒險體驗。