芳療核心理論認證課程通常分為以下三個階段：
基礎理論階段
這一階段主要介紹芳香療法的基本概念、歷史背景以及精油的化學組成。學員將學習精油的提取方法、分類、安全使用原則以及常見精油的特性與功效。此外，還會涉及人體生理學的基礎知識，幫助學員理解精油如何通過皮膚、呼吸系統和神經系統發揮作用。
套用與實踐階段
在此階段，學員將深入學習精油的實際套用方法，包括按摩技術、吸入法、擴香法以及局部塗抹等。課程還會涵蓋如何根據個人需求調配複方精油，並探討精油在情緒管理、皮膚護理、消化系統支持等方面的具體套用。此外，學員會通過案例分析學習如何為不同人群（如孕婦、兒童、老年人）制定個性化的芳療方案。
專業進階與認證階段
這一階段是課程的高級部分，重點在於提升學員的專業技能和臨床實踐能力。學員將學習如何評估客戶的健康狀況，設計綜合性的芳療方案，並掌握精油與其他自然療法的結合套用。課程還會涉及芳療的商業實踐，包括開設芳療工作室、產品推廣及客戶溝通技巧。完成此階段並通過考核後，學員將獲得芳療核心理論認證，具備獨立執業的能力。
這三個階段循序漸進，旨在幫助學員全面掌握芳香療法的理論與實踐技能，為未來的職業發展奠定堅實基礎。