隱藏的寶石寶可夢，通常指的是那些在《寶可夢》系列遊戲中較為稀有、難以捕捉或容易被玩家忽略的寶可夢。這些寶可夢可能因為其出現條件特殊、分佈範圍有限，或僅在特定版本中出現而被視為「隱藏的寶石」。以下是一些被認為是隱藏寶石的寶可夢：
拉帝亞斯（Latias）與拉帝歐斯（Latios）
這兩隻傳說寶可夢在《寶可夢 紅寶石/藍寶石》及後續重製版中出現，玩家需要滿足特定條件才能觸發劇情並捕捉。它們的稀有性與強大的能力讓它們成為許多玩家的目標。
霏歐納（Phione）與瑪納霏（Manaphy）
瑪納霏是幻之寶可夢，只能通過特殊活動或配信獲得，而霏歐納則是通過瑪納霏與百變怪孵蛋獲得。這兩隻寶可夢因其獨特的獲取方式而被視為隱藏的寶石。
異色寶可夢（色違寶可夢）
異色寶可夢是普通寶可夢的稀有變種，擁有不同的顏色。由於出現機率極低（通常為1/4096），捕捉到色違寶可夢被視為一種成就，尤其是那些特別受歡迎的色違寶可夢，如色違沙奈朵或色違路卡利歐。
阿爾宙斯（Arceus）
作為創世神寶可夢，阿爾宙斯在遊戲中極難獲得，通常需要通過特殊活動或配信。它的強大能力與神秘背景讓它成為玩家心目中的頂級隱藏寶石。
未知圖騰（Unown）
未知圖騰是一種特殊的寶可夢，擁有28種不同的形態（26個字母加上問號和驚嘆號）。收集所有形態的未知圖騰是一項極具挑戰性的任務，尤其是某些形態只能在特定地點找到。
基拉祈（Jirachi）
基拉祈是另一隻幻之寶可夢，通常只能通過特殊活動或配信獲得。它的可愛外觀與稀有性讓它成為許多玩家夢寐以求的寶可夢。
化石寶可夢
某些化石寶可夢，如化石翼龍、搖籃百合或戰槌龍，只能在特定地點通過復活化石獲得。這些寶可夢因其獨特的獲取方式而被視為隱藏的寶石。
這些隱藏的寶石寶可夢不僅因為其稀有性而受到追捧，還因為它們往往擁有獨特的設計、強大的能力或特殊的背景故事，成為《寶可夢》遊戲中不可或缺的一部分。