飛行系寶可夢在戰鬥中有著獨特的優勢，尤其是它們通常具備高速度和迴避率，能夠有效避開地面系攻擊。然而，飛行系寶可夢也有明顯的弱點，以下是幾種常見的剋星：
電系寶可夢
電系招式對飛行系寶可夢有雙倍傷害，因為飛行系對電系攻擊沒有抗性。例如，雷丘、電擊魔獸等電系寶可夢可以輕鬆擊敗飛行系對手。
岩石系寶可夢
岩石系招式對飛行系寶可夢同樣有雙倍傷害，且岩石系寶可夢通常防禦力較高，能夠承受飛行系的攻擊。例如，隆隆岩、班基拉斯等都是飛行系的強力剋星。
冰系寶可夢
冰系招式對飛行系寶可夢也有雙倍傷害，尤其是冰系寶可夢通常能學習範圍攻擊技能，對付飛行系寶可夢非常有效。例如，冰伊布、暴雪王等。
鋼系寶可夢
鋼系寶可夢通常防禦力極高，且能學習岩石系或電系招式，對飛行系寶可夢構成威脅。例如，巨金怪、鋼鎧鴉等。
特定技能
一些技能如「岩石封鎖」、「放電」等，能夠有效限制飛行系寶可夢的移動或造成高額傷害。
綜上所述，電系、岩石系、冰系和鋼系寶可夢是飛行系寶可夢的主要剋星。在戰鬥中合理選擇這些屬性的寶可夢或技能，可以輕鬆應對飛行系對手。