高雄醫學大學心理學系的課程設計旨在培養學生對心理學的全面理解與應用能力。課程內容涵蓋心理學的基礎理論與實務技能，並結合生物醫學知識，以培養具備專業素養的心理學人才。
在基礎理論方面，學生將學習普通心理學、發展心理學、社會心理學、認知心理學、人格心理學等核心課程，這些課程幫助學生建立對人類行為與心理過程的系統性理解。此外，學生也會學習心理統計學與研究方法，以掌握科學研究的基本工具與方法。
在應用領域，課程包括臨床心理學、諮商心理學、健康心理學、組織心理學等，這些課程讓學生了解心理學在醫療、教育、企業等領域的實際應用。高醫心理系特別強調生物心理學與神經科學的結合，學生將學習生理心理學、神經心理學等課程，以理解心理與生理之間的關聯。
此外，高醫心理系也提供實習機會，學生可以在醫院、學校、社區機構等場域進行實務訓練，將理論知識應用於實際情境中。整體而言，高醫心理系的課程設計兼具理論與實務，旨在培養學生具備專業知識與技能，以應對多元的心理學相關工作需求。