在《夢回十三爺》這部小說中，十三爺發現於寧是未來人的情節發生在故事的中後期。具體來說，十三爺在一次偶然的機會中，通過於寧的言行舉止和所掌握的先進知識，逐漸懷疑她的身份。隨著劇情的推進，於寧的一些行為和對未來的描述讓十三爺更加確信她來自未來。
最終，十三爺在一次深入的對話中直接向於寧求證，於寧也坦誠相告，承認了自己是未來人的身份。這一發現不僅加深了兩人之間的情感糾葛，也為後續的劇情發展埋下了伏筆。
這一情節的出現為故事增添了更多的懸念和情感衝突，使得整個故事更加引人入勝。