第三世代寶可夢是指在《寶可夢》系列遊戲中，首次出現在第三世代遊戲中的寶可夢。第三世代的遊戲包括《寶可夢 紅寶石》《寶可夢 藍寶石》以及後來的《寶可夢 綠寶石》。這一世代的遊戲於2002年在Game Boy Advance平台上發布，背景設定在豐緣地區（Hoenn）。
第三世代引入了135種新的寶可夢，使得寶可夢的總數達到了386種。這一世代的特點包括雙打對戰、寶可夢的特性、天氣系統以及寶可夢的性別差異等新機制。此外，第三世代還首次引入了寶可夢的華麗大賽，玩家可以通過培養寶可夢的美麗度、可愛度等屬性來參加比賽。
一些著名的第三世代寶可夢包括木守宮（Treecko）、火稚雞（Torchic）、水躍魚（Mudkip）等初始寶可夢，以及傳說中的寶可夢如蓋歐卡（Kyogre）、固拉多（Groudon）和烈空坐（Rayquaza）。這些寶可夢在後來的世代中仍然廣受歡迎，並在系列中扮演重要角色。
第三世代的遊戲不僅在玩法上進行了創新，還在圖形和音效上有了顯著提升，為《寶可夢》系列的發展奠定了重要基礎。